SeqCentral ฐานข้อมูลลำดับเบสของดีเอ็นเอบน Cloud Computing

, , Leave a comment

SeqCentral

การทำ human genome นั้น มีปริมาณชุดข้อมูลของลำดับเบสมหาศาล(ราว 3 พันล้านคู่เบส)  ปัจจุบันข้อมูลเหล่านี้ถูกประมวลผลด้วยซูปเปอร์คอมพิวเตอร์ที่ทำงานเพียงเครื่องเดียว ซึ่งมันไม่สามารถเชื่อมระหว่างข้อมูลจากนักวิทยาศาสตร์แต่ละคนได้ ในงาน TechCrunch Disrupt ณ วันที่ 28 กันยายน 2010 เว็บไซต์ SeqCentral ได้แก้ปัญหาดังกล่าว ด้วยการเปิดตัวศูนย์รวบรวมลำดับเบสของดีเอ็นเอจากนักวิทยาศาสตร์ ที่ทำงานวิจัยเกี่ยวกับ human genome เพื่อเป็นฐานข้อมูล และทำการจับคู่เหมือนของชุดข้อมูล

SeqCentral จะเพิ่มประสิทธิภาพในการจับคู่เหมือนของลำดับเบสของดีเอ็นเอบน Cloud Computing หรือ การประมวลผลแบบกลุ่มเมฆ การให้บริการจะเปิดให้นักวิทยาศาสตร์อัพโหลดข้อมูลลำดับเบสของดีเอ็นเอจากงานวิจัยของตัวเองขึ้น SeqCentral จากนั้นระบบจะจับคู่ข้อมูลนั้นกับฐานข้อมูลเดิมที่ได้รวบรวมจากนักวิทยาศาสตร์คนอื่นๆ ซึ่งจะทำให้รู้ว่าชุดข้อมูลที่ได้มานั้น เป็นข้อมูลใหม่หรือเป็นข้อมูลที่มีการค้นพบแล้ว

ข้อมูลในขั้นเริ่มต้นในตอนนี้จะถูกรวบรวมจากฐานข้อมูลที่มีอยู่แล้วจากมหาวิทยาลัยต่างๆ ศูนย์วิจัย บริษัทที่ทำงานวิจัยด้านนี้

SeqCentral มีค่าบริการ $99(3,025 บาท) ต่อปี  นอกจากจะช่วยให้การทำงานง่ายขึ้นแล้ว ทางผู้ให้บริการยังมีเป้าหมายในการเชื่อมกลุ่มของสมาชิกที่ทำงานด้านพันธุกรรมเข้าด้วยกันอีกด้วย เพื่อส่งเสริมความร่วมมือในการทำงานมากขึ้น

กลุ่มเป้าหมายของ SeqCentral คือกลุ่มนักวิทยาศาตร์ที่ทำงานเฉพาะทางด้านพันธุกรรม ซึ่งคาดว่ามีอยู่ราว 1 ล้านคน

ที่มา: https://techcrunch.com/2010/09/27/seqcentral-puts-dna-sequence-crunching-in-the-cloud

 

Leave a Reply

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.